実験的処置を加えた「実験的発症モデル」、突然変異により自然発症した「自然発症モデル」、人為的に突然変異を与えた「人為的変異誘発モデル」。胚性幹細胞embryonic stem（ES）cellやゲノム編集によって遺伝子を改変した「遺伝子改変モデル」（遺伝子を破壊したノックアウトマウス、遺伝子を挿入あるいは置換したノックインマウス、組織あるいは時期特異的に遺伝子発現を制御したコンディショナルマウスなど）が代表的である。