標準的な薬物動態解析法では、頻回に被験者全員の採血を行い必要なデータを取得するのに対して、母集団薬物動態解析法では、個々の被験者に対してまばらな時点で採血し、得られた多数の血中濃度から（母）集団としての平均的な薬物パラメータを推定し、被験者ごとの個別パラメータ値を予測する。